Der kommissarische Schulleiter des Moll-Gymnasiums ist der stellvertretende Schulleiter Christof Höger.
Daneben bildet die erweiterte Schulleitung das Leitungsgremium der Schule. Diese besteht im Allgemeinen aus dem Schulleiter, dessen Stellvertreter sowie den Abteilungsleitungen und ist u.a. für die Planung der Unterrichtsorganisation, Fragen der Schulentwicklung, Beratung der Schüler:innen und Leitung der Fachabteilungen zuständig.